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Interrogez et analysez la littérature savante à l’aide de la base de données OpenAlex. Cette compétence doit être utilisée lors de la recherche d’articles académiques, de l’analyse des tendances de recherche, de la recherche d’œuvres par des auteurs ou des institutions, du suivi des citations, de la découverte de publications en accès ouvert ou de la réalisation d’analyses bibliométriques sur plus de 240 millions d’œuvres savantes. Utilisez-la pour les recherches littéraires, l’analyse des productions de recherche, l’analyse des citations et les requêtes dans des bases de données académiques.

Interrogez la plateforme Open Targets sur les associations cible-maladie, la découverte des cibles thérapeutiques, les données de tractabilité/sécurité, les preuves génétiques/omiques et les médicaments connus, pour l’identification de cibles thérapeutiques.

Outil computationnel en pathologie pour l'analyse des images de diapositives complètes (WSI) et des données d'imagerie multiparamétrique. Utilisez cette compétence lors du travail avec des diapositives d'histopathologie, des images colorées H&E, l'immunofluorescence multiplexe (CODEX, Vectra), la protéomique spatiale, la détection/ségmentation des noyaux, la construction de graphes tissulaires ou l'entraînement de modèles ML sur des données pathologiques. Prend en charge plus de 160 formats de diapositives, y compris Aperio SVS, NDPI, DICOM, OME-TIFF, pour les flux de travail de pathologie digitale.

Accédez à RCSB PDB pour des structures 3D de protéines/acides nucléiques. Recherchez par texte/séquence/structure, téléchargez des coordonnées (PDB/mmCIF), récupérez des métadonnées, pour la biologie structurale et la découverte de médicaments.

Effectuez des recherches web alimentées par l'IA avec des informations en temps réel à l'aide des modèles Perplexity via LiteLLM et OpenRouter. Cette compétence doit être utilisée lors de recherches web pour des informations actuelles, de la recherche de littérature scientifique récente, l'obtention de réponses fondées avec citations de sources ou l'accès à des informations au-delà de la date de cutoff des connaissances du modèle. Fournit accès à plusieurs modèles Perplexity, notamment Sonar Pro, Sonar Pro Search (recherche agentique avancée) et Sonar Reasoning Pro, via une seule clé API OpenRouter.

Concevez des cas de test complets à l'aide de PICT (Pairwise Independent Combinatorial Testing) pour tout élément de spécification ou de code. Analysez les entrées, générez des modèles PICT avec des paramètres, des valeurs et des contraintes pour des scénarios valides à l'aide du test pairwise. Produisez le modèle PICT, un tableau markdown des cas de test et les résultats attendus.

Bibliothèque de visualisation interactive de données scientifiques et statistiques pour Python. Utilisez-la lors de la création de graphiques, de tracés ou de visualisations, y compris des diagrammes de dispersion, des graphiques linéaires, des histogrammes, des cartes thermiques, des tracés 3D, des cartes géographiques, des distributions statistiques, des graphiques financiers et des tableaux de bord. Prend en charge à la fois les visualisations rapides (Plotly Express) et la personnalisation détaillée (objets graphiques). Génère des sorties HTML interactives ou des images statiques (PNG, PDF, SVG).

Bibliothèque Fast DataFrame (Apache Arrow). Sélection, filtrage, groupement, jointures, évaluation paresseuse, E/S CSV/Parquet, API d'expression, pour des flux de travail d'analyse de données haute performance.

Kit d'outils pour la leadership stratégique produit destiné au Head of Product, incluant la génération de cascade OKR, l'analyse du marché, la définition de la vision et le scaling de l'équipe. Utilisez-le pour la planification stratégique, l'alignement des objectifs, l'analyse concurrentielle et la conception organisationnelle.

Générateur complet de planification de projet et de documentation pour les projets logiciels. Crée des documents de spécifications structurés, des documents de conception système et des plans de répartition des tâches avec suivi de l'implémentation. Utilisez-le lors du lancement d'un nouveau projet, de la définition des spécifications, de la création de conceptions techniques ou de la décomposition de systèmes complexes en tâches réalisables. Prend en charge le format des histoires utilisateur, les critères d'acceptation, la conception des composants, les spécifications API et la décomposition hiérarchique des tâches avec traçabilité des exigences.

Utilisez cette compétence lors de la rédaction de commandes, de hooks, de compétences pour Agent ou de invites pour des sous-agents ou toute autre interaction LLM, y compris l'optimisation des invites, l'amélioration des résultats LLM ou la conception de modèles d'invites de production.

Interrogez PubChem via l'API PUG-REST/PubChemPy (110 millions de composés et plus). Recherchez par nom/CID/SMILES, récupérez des propriétés, effectuez des recherches de similarité/sous-structure, de bioactivité pour la chimio-informatique.

Accès direct à PubMed via API REST. Requêtes Boolean/MeSH avancées, API E-utilities, traitement par lot, gestion des citations. Pour les flux de travail Python, préférez biopython (Bio.Entrez). Utilisez ceci pour le travail HTTP/REST direct ou les implémentations API personnalisées.

Boîte à outils en science des matériaux. Structures cristallines (CIF, POSCAR), diagrammes de phases, structure de bandes, DOS, intégration du Materials Project, conversion de formats, pour la science des matériaux computationnelle.

Modélisation bayésienne avec PyMC. Créer des modèles hiérarchiques, MCMC (NUTS), inférence variationnelle, comparaison LOO/WAIC, vérifications postérieures, pour la programmation probabiliste et l’inférence.

Cadre d'optimisation multiobjectif. NSGA-II, NSGA-III, MOEA/D, fronts de Pareto, gestion des contraintes, benchmarks (ZDT, DTLZ), pour les problèmes de conception et d'optimisation ingénieriques.

Boîte à outils pour fichiers génomiques. Lecture/écriture d'alignements SAM/BAM/CRAM, de variants VCF/BCF, de séquences FASTA/FASTQ, extraction de régions, calcul de la couverture, pour les pipelines de traitement de données NGS.

Therapeutics Data Commons. Ensembles de données de découverte de médicaments prêts pour l'IA (ADME, toxicité, DTI), benchmarks, divisions de échafaudage, oracles moléculaires, pour le ML thérapeutique et la prédiction pharmacologique.

Kit complet de calcul quantique pour construire, optimiser et exécuter des circuits quantiques. Utilisez-le lors de travail avec des algorithmes quantiques, des simulations ou du matériel quantique, notamment (1) la construction de circuits quantiques avec des portes et des mesures, (2) l'exécution d'algorithmes quantiques (VQE, QAOA, Grover), (3) la transpilation/optimisation de circuits pour du matériel, (4) l'exécution sur IBM Quantum ou d'autres fournisseurs, (5) la chimie quantique et la science des matériaux, (6) l'apprentissage automatique quantique, (7) la visualisation des circuits et des résultats, ou (8) toute tâche de développement en calcul quantique.

Boîte à outils de chimioinformatique pour un contrôle moléculaire fin. Analyse SMILES/SDF, descripteurs (PM, LogP, TPSA), empreintes digitales, recherche de sous-structure, génération 2D/3D, similarité, réactions. Pour des flux de travail standard avec une interface plus simple, utilisez datamol (wrapper autour de RDKit). Utilisez rdkit pour un contrôle avancé, une désinfection personnalisée et des algorithmes spécialisés.

Interrogez l'API REST Reactome pour l'analyse de voies métaboliques, l'enrichissement, la cartographie gène-voie, les voies liées aux maladies, les interactions moléculaires et l'analyse d'expression, dans le cadre des études de biologie des systèmes.

Kit de génération PDF. Créer des factures, des rapports, des certificats, des formulaires, des graphiques, des tableaux, des codes-barres, des codes QR, APIs Canvas/Platypus, pour l'automatisation professionnelle de documents.

Analyse RNA-seq à une cellule. Chargement des données .h5ad/10X, contrôle qualité, normalisation, PCA/UMAP/t-SNE, clustering Leiden, gènes marqueurs, annotation de type cellulaire, trajectoire, pour l'analyse RNA-seq à une cellule.

Visualisation statistique. Diagrammes de dispersion, boîtes à moustaches, violons, cartes thermiques, graphes par paires, régression, matrices de corrélation, KDE, graphes facettés, pour l'analyse exploratoire et les figures de publication.