⚙️ Backend

agent-recall offre une mémoire persistante et cumulative pour les agents IA via des outils MCP tels que session_start, session_end, remember, recall et check, avec stockage local en Markdown, zéro cloud, zéro télémétrie et compatibilité Obsidian. Configuré via `ar setup supabase`, recall() exploite la similarité cosinus pgvector sur les embeddings OpenAI/Voyage pour une recherche sémantique via la même API, revenant gracieusement à la recherche locale si le backend n’est pas configuré.

Kits de développement pour la responsabilité produit agile destiné au Product Owner Senior incluant la génération de user stories conformes à INVEST, la planification de sprint, la gestion du backlog et le suivi de la vélocité. Utilisé pour l'écriture de stories, la planification de sprint, la communication avec les parties prenantes et les cérémonies agiles.

Accédez aux plus de 200 millions de structures de protéines prédites par l'IA d'AlphaFold. Récupérez les structures par ID UniProt, téléchargez les fichiers PDB/mmCIF, analysez les indicateurs de confiance (pLDDT, PAE), pour la découverte de médicaments et la biologie structurale.

Expert sur l'API Anthropic Claude, les modèles, l'ingénierie de prompts, l'appel de fonctions, la vision et les meilleures pratiques. Déclenche sur anthropic, claude, api, prompt, appel de fonctions, vision, messages api, embeddings

Guide la conception stable d'API et d'interfaces. À utiliser lors de la conception d'API, de limites de modules ou de toute interface publique. À utiliser lors de la création de points de terminaison REST ou GraphQL, de la définition de contrats de types entre modules ou de l'établissement de limites entre frontend et backend.

Documentation de l'Apify JS SDK - Web scraping, crawling et développement d'Actor

Bibliothèque Python complète pour l'astronomie et l'astrophysique. Cette compétence doit être utilisée lors du travail avec des données astronomiques, notamment des coordonnées célestes, des unités physiques, des fichiers FITS, des calculs cosmologiques, des systèmes temporels, des tables, des systèmes de coordonnées mondiales (WCS) et l'analyse de données astronomiques. Utilisez-la pour les tâches impliquant des transformations de coordonnées, des conversions d'unités, la manipulation de fichiers FITS, des calculs de distances cosmologiques, des conversions d'échelles temporelles ou le traitement de données astronomiques.

Guide complet du développement backend pour microservices Node.js/Express/TypeScript. Utilisez-le lors de la création de routes, contrôleurs, services, référentiels, middleware ou lors du travail avec des API Express, l'accès à la base de données Prisma, le suivi des erreurs Sentry, la validation Zod, unifiedConfig, l'injection de dépendances ou les modèles asynchrones. Couvre l'architecture en couches (routes → contrôleurs → services → référentiels), le modèle BaseController, la gestion des erreurs, la surveillance des performances, les stratégies de test et la migration depuis des modèles hérités.

Modèles d'architecture backend, conception d'API, optimisation des bases de données et bonnes pratiques côté serveur pour les routes API Node.js, Express et Next.js. À utiliser lors de la construction ou de la révision des routes API Node.js, Express ou Next.js et de leur accès aux données.

Intégration de la plateforme R&D Benchling. Accès au registre (ADN, protéines), à l’inventaire, aux entrées ELN, aux flux de travail via API, création d’applications Benchling, interrogation du Data Warehouse, pour l’automatisation de la gestion des données de laboratoire.

Kit Python principal pour la biologie moléculaire. Préféré pour les requêtes PubMed/NCBI basées sur Python (Bio.Entrez), la manipulation de séquences, l'analyse de fichiers (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), les workflows BLAST avancés, les structures, la phylogénétique. Pour un BLAST rapide, utilisez gget. Pour une API REST directe, utilisez pubmed-database.

Outil de recherche de base de données efficace pour le serveur de prépublications bioRxiv. Utilisez cette compétence lors de la recherche de prépublications en sciences de la vie par mots-clés, auteurs, plages de dates ou catégories, lors de la récupération des métadonnées des articles, du téléchargement de PDF ou de la réalisation de revues bibliographiques.

Outil Python principal pour plus de 40 services de bioinformatique. Préféré pour les flux de travail multi-bases de données : UniProt, KEGG, ChEMBL, PubChem, Reactome, QuickGO. API unifiée pour les requêtes, le mappage des ID, l'analyse des voies métaboliques. Pour un contrôle REST direct, utilisez les compétences de base de données individuelles (uniprot-database, kegg-database).

Bun comme runtime, gestionnaire de paquets, bundler et lanceur de tests. Quand choisir Bun plutôt que Node, notes de migration et support Vercel.

Garde-fous de sécurité pour les commandes destructrices. (gstack)

Interrogez le Census CZ CELLxGENE (61M+ cellules). Filtrer par type de cellule/tissu/maladie, récupérer les données d'expression, intégrer avec scanpy/PyTorch, pour l'analyse monocellulaire à l'échelle de la population.

Guidance de direction pour la prise de décision stratégique, le développement organisationnel et la gestion des parties prenantes. Inclut un analyseur de stratégie, une modélisation de scénarios financiers, des cadres de gouvernance du conseil d’administration et des playbooks de relations avec les investisseurs. Utiliser lors de la planification stratégique, de la préparation de présentations au conseil d’administration, de la gestion des investisseurs, du développement de la culture organisationnelle, de la prise de décisions exécutives, ou lorsque l’utilisateur mentionne PDG, planification stratégique, réunions du conseil d’administration, mises à jour des investisseurs, leadership organisationnel ou stratégie exécutive.

Interrogez les molécules bioactives et les données de découverte de médicaments de ChEMBL. Recherchez des composés par structure/propriétés, récupérez des données de bioactivité (IC50, Ki), trouvez des inhibiteurs, effectuez des études SAR, pour la chimie médicinale.

Générateur interactif de hooks pour Claude Code. Se déclenche lorsque l'utilisateur mentionne la création de hooks, PreToolUse, PostToolUse, la validation des hooks, la configuration des hooks, les hooks dans settings.json ou souhaite automatiser des workflows d'exécution d'outils.

Interrogez ClinicalTrials.gov via l'API v2. Recherchez des essais par condition, médicament, emplacement, statut ou phase. Récupérez les détails des essais par ID NCT, exportez les données, pour la recherche clinique et l'appariement de patients.

Accédez aux données pharmacogénomiques d'Access ClinPGx (successeur de PharmGKB). Interrogez les interactions gène-médicament, les lignes directrices CPIC, les fonctions alléliques pour la médecine personnalisée et les décisions de dosage guidées par le génotype.

Interrogez NCBI ClinVar pour la signification clinique des variants. Recherchez par gène/position, interprétez les classifications de pathogénicité, accédez via l'API E-utilities ou FTP, annotatez les VCF, pour la médecine génomique.

Modélisation métabolique à base de contraintes (COBRA). FBA, FVA, invalidations géniques, échantillonnage de flux, modèles SBML, pour l'analyse en biologie des systèmes et ingénierie métabolique.

Exécutez du code Python localement avec accès à l'API Marketplace pour une économie de plus de 90 % sur les opérations en bloc. S'active lorsque l'utilisateur demande des opérations en bloc (10+ fichiers), des workflows multi-étapes complexes, un traitement itératif ou mentionne l'efficacité/performance.