Base de données AlphaFold

Kit Python principal pour la biologie moléculaire. Préféré pour les requêtes PubMed/NCBI basées sur Python (Bio.Entrez), la manipulation de séquences, l'analyse de fichiers (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), les workflows BLAST avancés, les structures, la phylogénétique. Pour un BLAST rapide, utilisez gget. Pour une API REST directe, utilisez pubmed-database.

Bibliothèque Python complète pour l'astronomie et l'astrophysique. Cette compétence doit être utilisée lors du travail avec des données astronomiques, notamment des coordonnées célestes, des unités physiques, des fichiers FITS, des calculs cosmologiques, des systèmes temporels, des tables, des systèmes de coordonnées mondiales (WCS) et l'analyse de données astronomiques. Utilisez-la pour les tâches impliquant des transformations de coordonnées, des conversions d'unités, la manipulation de fichiers FITS, des calculs de distances cosmologiques, des conversions d'échelles temporelles ou le traitement de données astronomiques.

Intégration de la plateforme R&D Benchling. Accès au registre (ADN, protéines), à l’inventaire, aux entrées ELN, aux flux de travail via API, création d’applications Benchling, interrogation du Data Warehouse, pour l’automatisation de la gestion des données de laboratoire.

Cette compétence doit être utilisée lors du travail avec des matrices de données annotées en Python, en particulier pour l'analyse génomique à cellule unique, la gestion des mesures expérimentales avec des métadonnées, ou le traitement de jeux de données biologiques à grande échelle. Utilisez-la lors de tâches impliquant des objets AnnData, des fichiers h5ad, des données de RNA-seq à cellule unique ou une intégration avec les outils scanpy/scverse.