⚙️ Backend

Acceda a más de 200 millones de estructuras de proteínas predichas por IA de AlphaFold. Recupere estructuras por ID de UniProt, descargue archivos PDB/mmCIF, analice métricas de confianza (pLDDT, PAE) para la descubrimiento de fármacos y la biología estructural.

Biblioteca Python comprensiva para astronomía y astrofísica. Esta habilidad debe usarse al trabajar con datos astronómicos que incluyen coordenadas celestes, unidades físicas, archivos FITS, cálculos cosmológicos, sistemas de tiempo, tablas, sistemas de coordenadas mundiales (WCS) y análisis de datos astronómicos. Usar cuando las tareas impliquen transformaciones de coordenadas, conversiones de unidades, manipulación de archivos FITS, cálculos de distancias cosmológicas, conversiones de escalas de tiempo o procesamiento de datos astronómicos.

Guía completa de desarrollo backend para microservicios Node.js/Express/TypeScript. Utilizar al crear rutas, controladores, servicios, repositorios, middleware o al trabajar con APIs Express, acceso a bases de datos Prisma, seguimiento de errores Sentry, validación Zod, unifiedConfig, inyección de dependencias o patrones asíncronos. Cubre arquitectura por capas (rutas → controladores → servicios → repositorios), patrón BaseController, manejo de errores, monitoreo de rendimiento, estrategias de prueba y migración de patrones legado.

Integración de la plataforma R&D de Benchling. Acceso al registro (ADN, proteínas), inventario, entradas de ELN, flujos de trabajo a través de API, creación de aplicaciones Benchling, consulta del Almacén de Datos, para la automatización de la gestión de datos de laboratorio.

Kit de herramientas Python principal para biología molecular. Preferido para consultas Python-based PubMed/NCBI (Bio.Entrez), manipulación de secuencias, análisis de archivos (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), flujos de trabajo avanzados de BLAST, estructuras, filogenética. Para BLAST rápido, use gget. Para API REST directa, use pubmed-database.

Herramienta principal de Python para más de 40 servicios de bioinformática. Preferida para flujos de trabajo multi-base de datos: UniProt, KEGG, ChEMBL, PubChem, Reactome, QuickGO. API unificada para consultas, mapeo de ID y análisis de vías. Para control directo de REST, utilice las habilidades individuales de la base de datos (uniprot-database, kegg-database).

Consulta las moléculas bioactivas y los datos de descubrimiento de fármacos de ChEMBL. Busca compuestos por estructura/propiedades, recupera datos de bioactividad (IC50, Ki), encuentra inhibidores, realiza estudios SAR, para química medicinal.

Orientación de liderazgo técnico para equipos de ingeniería, decisiones de arquitectura y estrategia tecnológica. Incluye analizador de deuda técnica, calculadora de escalado de equipos, marcos de métricas de ingeniería, herramientas de evaluación tecnológica y plantillas ADR. Usar al evaluar deuda técnica, escalar equipos de ingeniería, evaluar tecnologías, tomar decisiones de arquitectura, establecer métricas de ingeniería o cuando el usuario mencione CTO, deuda técnica, deuda técnica (repetición en el original, pero en español se mantiene), escalado de equipos, decisiones de arquitectura, evaluación tecnológica, métricas de ingeniería, métricas DORA o estrategia tecnológica. 注：原文本中"tech debt"和"technical debt"都是"deuda técnica"，在翻译中统一为"deuda técnica"，避免重复冗余。

Accede al Archivo Europeo de Nucleótidos vía API/FTP. Recupera secuencias de ADN/ARN, lecturas brutas (FASTQ), ensamblajes de genomas por acceso, para flujos de trabajo de genómica y bioinformática. Admite múltiples formatos.

Consultar la API REST de la base de datos de genomas Ensembl para más de 250 especies. Búsquedas de genes, recuperación de secuencias, análisis de variantes, genómica comparativa, ortólogos, predicciones VEP, para investigación genómica.

Consultar la API openFDA sobre medicamentos, dispositivos, eventos adversos, retiradas, presentaciones regulatorias (510k, PMA) y identificación de sustancias (UNII) para análisis de datos regulatorios de la FDA y investigación de seguridad.

Esta habilidad procesa archivos que contienen etiquetas figlet y las reemplaza con representaciones de arte ASCII. Detecta y conserva estilos de comentarios (barra diagonal hacia adelante barra diagonal hacia adelante, almohadilla, doble guión, barra diagonal hacia adelante asterisco), gestiona automáticamente dependencias de Node.js y admite más de 400 fuentes (por defecto la fuente estándar). La habilidad debería usarse cuando un usuario solicita convertir texto marcado en un archivo a arte ASCII usando sintaxis de etiqueta figlet, o cuando quieren listar las fuentes disponibles.

Kit de herramientas CLI/Python para consultas de bioinformática rápidas. Preferido para búsquedas BLAST rápidas. Acceso a más de 20 bases de datos: información de genes (Ensembl/UniProt), AlphaFold, ARCHS4, Enrichr, OpenTargets, COSMIC, descargas de genomas. Para procesamiento avanzado de BLAST o por lotes, use biopython. Para integración de múltiples bases de datos, use bioservices.

Consultar el NHGRI-EBI GWAS Catalog para asociaciones SNP-rasgo. Buscar variantes por ID rs, enfermedad/rasgo, gen, recuperar valores p y estadísticas resumidas, para epidemiología genética y puntuaciones de riesgo poligénico.

Integración de la API del cuaderno de laboratorio electrónico. Accede a cuadernos, gestiona entradas/archivos adjuntos, realiza copias de seguridad de cuadernos, integra con Protocols.io/Jupyter/REDCap, para flujos de trabajo programáticos de ELN.

Esta habilidad debe usarse al trabajar con LaminDB, un marco de datos de código abierto para la biología que hace que los datos sean consultables, trazables, reproducibles y FAIR. Usar al gestionar conjuntos de datos biológicos (scRNA-seq, espacial, citometría de flujo, etc.), seguir flujos de trabajo computacionales, curar y validar datos con ontologías biológicas, construir data lakehouses o garantizar el linaje de datos y la reproducibilidad en la investigación biológica. Cubre gestión de datos, anotación, ontologías (genes, tipos celulares, enfermedades, tejidos), validación de esquema, integraciones con gestores de flujos de trabajo (Nextflow, Snakemake) y plataformas MLOps (W&B, MLflow), y estrategias de implementación.

Documentación de la API de Linode

Crea y valida 7 documentos de proyecto (requisitos, arquitectura, pila_tecnológica, especificación_api, esquema_de_base_de_datos, pautas_de_diseño, guía_de_ejecución). Cuarto trabajador en ln-110-documents-pipeline.

CREAR/REPLANIFICAR Épicos desde el alcance (3-7 Épicos). Vista previa en lote + Extracción automática. Patrón Descomponer primero. Descubre automáticamente la ID del equipo.

Accede a la Plataforma de Metabolómica del NIH mediante API REST (más de 4.200 estudios). Consulta metabolitos, nomenclatura RefMet, datos MS/NMR, búsquedas m/z, metadatos de estudios, para metabolómica y descubrimiento de biomarcadores.

Caracterización molecular para ML (más de 100 caracterizadores). ECFP, MACCS, descriptores, modelos preentrenados (ChemBERTa), convertir SMILES a características, para QSAR y ML molecular.

Documentación de N8N - Plataforma de automatización de flujos de trabajo con capacidades de IA

Documentación de la API Ollama

Acceda a RCSB PDB para estructuras 3D de proteínas/ácidos nucleicos. Busque por texto/secuencia/estructura, descargue coordenadas (PDB/mmCIF), recupere metadatos, para biología estructural y descubrimiento de fármacos.