⚙️ Backend

Acceda a más de 200 millones de estructuras de proteínas predichas por IA de AlphaFold. Recupere estructuras por ID de UniProt, descargue archivos PDB/mmCIF, analice métricas de confianza (pLDDT, PAE) para la descubrimiento de fármacos y la biología estructural.

Biblioteca Python comprensiva para astronomía y astrofísica. Esta habilidad debe usarse al trabajar con datos astronómicos que incluyen coordenadas celestes, unidades físicas, archivos FITS, cálculos cosmológicos, sistemas de tiempo, tablas, sistemas de coordenadas mundiales (WCS) y análisis de datos astronómicos. Usar cuando las tareas impliquen transformaciones de coordenadas, conversiones de unidades, manipulación de archivos FITS, cálculos de distancias cosmológicas, conversiones de escalas de tiempo o procesamiento de datos astronómicos.

Guía completa de desarrollo backend para microservicios Node.js/Express/TypeScript. Utilizar al crear rutas, controladores, servicios, repositorios, middleware o al trabajar con APIs Express, acceso a bases de datos Prisma, seguimiento de errores Sentry, validación Zod, unifiedConfig, inyección de dependencias o patrones asíncronos. Cubre arquitectura por capas (rutas → controladores → servicios → repositorios), patrón BaseController, manejo de errores, monitoreo de rendimiento, estrategias de prueba y migración de patrones legado.

Patrones de arquitectura de backend, diseño de API, optimización de bases de datos y mejores prácticas del lado del servidor para rutas de API de Node.js, Express y Next.js. Úsalo al crear o revisar rutas de API de Node.js, Express o Next.js y su acceso a datos.

Integración de la plataforma R&D de Benchling. Acceso al registro (ADN, proteínas), inventario, entradas de ELN, flujos de trabajo a través de API, creación de aplicaciones Benchling, consulta del Almacén de Datos, para la automatización de la gestión de datos de laboratorio.

Kit de herramientas Python principal para biología molecular. Preferido para consultas Python-based PubMed/NCBI (Bio.Entrez), manipulación de secuencias, análisis de archivos (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), flujos de trabajo avanzados de BLAST, estructuras, filogenética. Para BLAST rápido, use gget. Para API REST directa, use pubmed-database.

Herramienta eficiente de búsqueda en bases de datos para el servidor de preimpresos bioRxiv. Usa esta habilidad al buscar preimpresos de ciencias de la vida por palabras clave, autores, rangos de fechas o categorías, recuperar metadatos de artículos, descargar PDFs o realizar revisiones de literatura.

Herramienta principal de Python para más de 40 servicios de bioinformática. Preferida para flujos de trabajo multi-base de datos: UniProt, KEGG, ChEMBL, PubChem, Reactome, QuickGO. API unificada para consultas, mapeo de ID y análisis de vías. Para control directo de REST, utilice las habilidades individuales de la base de datos (uniprot-database, kegg-database).

Consulta las moléculas bioactivas y los datos de descubrimiento de fármacos de ChEMBL. Busca compuestos por estructura/propiedades, recupera datos de bioactividad (IC50, Ki), encuentra inhibidores, realiza estudios SAR, para química medicinal.

Consultar ClinicalTrials.gov a través de la API v2. Buscar ensayos clínicos por condición, medicamento, ubicación, estado o fase. Recuperar detalles del ensayo clínico por ID NCT, exportar datos, para investigación clínica y emparejamiento de pacientes.

Acceda a los datos farmacogenómicos de ClinPGx (sucesor de PharmGKB). Consulte interacciones gen-fármaco, directrices CPIC, funciones alélicas, para medicina de precisión y decisiones de dosificación guiada por genotipo.

Consulte NCBI ClinVar para la significancia clínica de las variantes. Busque por gen/posición, interprete las clasificaciones de patogenicidad, acceda mediante API E-utilities o FTP, anote VCF, para medicina genómica.

Transfiera código entre archivos con precisión basada en líneas. Úselo cuando los usuarios soliciten copiar código de un lugar a otro, mover funciones o clases entre archivos, extraer bloques de código o insertar código en números de línea específicos.

Accede a la base de datos de mutaciones cancerosas COSMIC. Consulta mutaciones somáticas, Censo de Genes del Cáncer, firmas mutacionales y fusiones génicas para investigación del cáncer y oncología de precisión. Requiere autenticación.

Orientación de liderazgo técnico para equipos de ingeniería, decisiones de arquitectura y estrategia tecnológica. Incluye analizador de deuda técnica, calculadora de escalado de equipos, marcos de métricas de ingeniería, herramientas de evaluación tecnológica y plantillas ADR. Usar al evaluar deuda técnica, escalar equipos de ingeniería, evaluar tecnologías, tomar decisiones de arquitectura, establecer métricas de ingeniería o cuando el usuario mencione CTO, deuda técnica, deuda técnica (repetición en el original, pero en español se mantiene), escalado de equipos, decisiones de arquitectura, evaluación tecnológica, métricas de ingeniería, métricas DORA o estrategia tecnológica. 注：原文本中"tech debt"和"technical debt"都是"deuda técnica"，在翻译中统一为"deuda técnica"，避免重复冗余。

Trabaja con MongoDB (base de datos de documentos, documentos BSON, tuberías de agregación, nube Atlas) y PostgreSQL (base de datos relacional, consultas SQL, CLI psql, pgAdmin). Úsalo al diseñar esquemas de bases de datos, escribir consultas y agregaciones, optimizar índices para el rendimiento, realizar migraciones de bases de datos, configurar replicación y particionamiento, implementar estrategias de copias de seguridad y restauración, gestionar usuarios y permisos de bases de datos, analizar el rendimiento de consultas o administrar bases de datos de producción.

Accede y analiza información comprensiva de medicamentos de la base de datos DrugBank, incluyendo propiedades de medicamentos, interacciones, blancos, vías, estructuras químicas y datos de farmacología. Esta habilidad debe usarse al trabajar con datos farmacéuticos, investigación de descubrimiento de medicamentos, estudios de farmacología, análisis de interacciones medicamento-medicamento, identificación de blancos, búsquedas de similitud química, predicciones ADMET o cualquier tarea que requiera información detallada sobre medicamentos y blancos de medicamentos de DrugBank.

Accede al Archivo Europeo de Nucleótidos vía API/FTP. Recupera secuencias de ADN/ARN, lecturas brutas (FASTQ), ensamblajes de genomas por acceso, para flujos de trabajo de genómica y bioinformática. Admite múltiples formatos.

Consultar la API REST de la base de datos de genomas Ensembl para más de 250 especies. Búsquedas de genes, recuperación de secuencias, análisis de variantes, genómica comparativa, ortólogos, predicciones VEP, para investigación genómica.

Conjunto de herramientas para árboles filogenéticos (ETE). Manipulación de árboles (Newick/NHX), detección de eventos evolutivos, ortología/paralogía, taxonomía NCBI, visualización (PDF/SVG), para filogenómica.

Consultar la API openFDA sobre medicamentos, dispositivos, eventos adversos, retiradas, presentaciones regulatorias (510k, PMA) y identificación de sustancias (UNII) para análisis de datos regulatorios de la FDA y investigación de seguridad.

Desglose las solicitudes de funcionalidades en planes detallados y implementables con tareas claras. Úselo cuando el usuario solicite una nueva funcionalidad, mejora o cambio complejo.

Esta habilidad procesa archivos que contienen etiquetas figlet y las reemplaza con representaciones de arte ASCII. Detecta y conserva estilos de comentarios (barra diagonal hacia adelante barra diagonal hacia adelante, almohadilla, doble guión, barra diagonal hacia adelante asterisco), gestiona automáticamente dependencias de Node.js y admite más de 400 fuentes (por defecto la fuente estándar). La habilidad debería usarse cuando un usuario solicita convertir texto marcado en un archivo a arte ASCII usando sintaxis de etiqueta figlet, o cuando quieren listar las fuentes disponibles.

Consulte NCBI Gene a través de la API E-utilities/Datasets. Busque por símbolo/ID, recupere información del gen (RefSeqs, GO, ubicaciones, fenotipos), búsquedas por lotes, para anotación de genes y análisis funcional.