Base de Datos Alphafold

Kit de herramientas Python principal para biología molecular. Preferido para consultas Python-based PubMed/NCBI (Bio.Entrez), manipulación de secuencias, análisis de archivos (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), flujos de trabajo avanzados de BLAST, estructuras, filogenética. Para BLAST rápido, use gget. Para API REST directa, use pubmed-database.

Biblioteca Python comprensiva para astronomía y astrofísica. Esta habilidad debe usarse al trabajar con datos astronómicos que incluyen coordenadas celestes, unidades físicas, archivos FITS, cálculos cosmológicos, sistemas de tiempo, tablas, sistemas de coordenadas mundiales (WCS) y análisis de datos astronómicos. Usar cuando las tareas impliquen transformaciones de coordenadas, conversiones de unidades, manipulación de archivos FITS, cálculos de distancias cosmológicas, conversiones de escalas de tiempo o procesamiento de datos astronómicos.

Integración de la plataforma R&D de Benchling. Acceso al registro (ADN, proteínas), inventario, entradas de ELN, flujos de trabajo a través de API, creación de aplicaciones Benchling, consulta del Almacén de Datos, para la automatización de la gestión de datos de laboratorio.

Esta habilidad se debe usar cuando se trabaja con matrices de datos anotados en Python, especialmente para análisis de genómica de células individuales, gestión de mediciones experimentales con metadatos o manejo de conjuntos de datos biológicos a gran escala. Usarla cuando las tareas involucren objetos AnnData, archivos h5ad, datos de RNA-seq de células individuales o integración con herramientas scanpy/scverse.