⚙️ Backend

Acceda a más de 200 millones de estructuras de proteínas predichas por IA de AlphaFold. Recupere estructuras por ID de UniProt, descargue archivos PDB/mmCIF, analice métricas de confianza (pLDDT, PAE) para la descubrimiento de fármacos y la biología estructural.

Especialista en Anthropic Claude API, modelos, ingeniería de prompts, llamadas a funciones, visión y mejores prácticas. Se activa con anthropic, claude, api, prompt, llamadas a funciones, visión, messages api, embeddings

Guía el diseño estable de API e interfaces. Úsala al diseñar APIs, límites de módulos o cualquier interfaz pública. Úsala al crear endpoints REST o GraphQL, definir contratos de tipos entre módulos o establecer límites entre frontend y backend.

Documentación del SDK Apify JS - Scraping web, crawling y desarrollo de Actores

Patrones de arquitectura de backend, diseño de API, optimización de bases de datos y mejores prácticas del lado del servidor para rutas de API de Node.js, Express y Next.js. Úsalo al crear o revisar rutas de API de Node.js, Express o Next.js y su acceso a datos.

Integración de la plataforma R&D de Benchling. Acceso al registro (ADN, proteínas), inventario, entradas de ELN, flujos de trabajo a través de API, creación de aplicaciones Benchling, consulta del Almacén de Datos, para la automatización de la gestión de datos de laboratorio.

Kit de herramientas Python principal para biología molecular. Preferido para consultas Python-based PubMed/NCBI (Bio.Entrez), manipulación de secuencias, análisis de archivos (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), flujos de trabajo avanzados de BLAST, estructuras, filogenética. Para BLAST rápido, use gget. Para API REST directa, use pubmed-database.

Herramienta eficiente de búsqueda en bases de datos para el servidor de preimpresos bioRxiv. Usa esta habilidad al buscar preimpresos de ciencias de la vida por palabras clave, autores, rangos de fechas o categorías, recuperar metadatos de artículos, descargar PDFs o realizar revisiones de literatura.

Acceda a los datos farmacogenómicos de ClinPGx (sucesor de PharmGKB). Consulte interacciones gen-fármaco, directrices CPIC, funciones alélicas, para medicina de precisión y decisiones de dosificación guiada por genotipo.

Accede al Archivo Europeo de Nucleótidos vía API/FTP. Recupera secuencias de ADN/ARN, lecturas brutas (FASTQ), ensamblajes de genomas por acceso, para flujos de trabajo de genómica y bioinformática. Admite múltiples formatos.

Consultar la API REST de la base de datos de genomas Ensembl para más de 250 especies. Búsquedas de genes, recuperación de secuencias, análisis de variantes, genómica comparativa, ortólogos, predicciones VEP, para investigación genómica.

Consulte NCBI Gene a través de la API E-utilities/Datasets. Busque por símbolo/ID, recupere información del gen (RefSeqs, GO, ubicaciones, fenotipos), búsquedas por lotes, para anotación de genes y análisis funcional.

Consultar el NHGRI-EBI GWAS Catalog para asociaciones SNP-rasgo. Buscar variantes por ID rs, enfermedad/rasgo, gen, recuperar valores p y estadísticas resumidas, para epidemiología genética y puntuaciones de riesgo poligénico.

Accede a la Base de Datos del Metaboloma Humano (más de 220 000 metabolitos). Busca por nombre/ID/estructura, recupera propiedades químicas, datos de biomarcadores, espectros NMR/MS, vías metabólicas, para metabolómica e identificación.

Acceso directo a la API REST de KEGG (solo para uso académico). Análisis de vías metabólicas, mapeo gen-vía, vías metabólicas, interacciones medicamentosas, conversión de ID. Para flujos de trabajo de Python con múltiples bases de datos, preferir bioservices. Usar esto para trabajo directo HTTP/REST o control específico de KEGG.

Integración de la API del cuaderno de laboratorio electrónico. Accede a cuadernos, gestiona entradas/archivos adjuntos, realiza copias de seguridad de cuadernos, integra con Protocols.io/Jupyter/REDCap, para flujos de trabajo programáticos de ELN.

Documentación de la API de Linode

CREAR/REPLANIFICAR Historias para Épica (5-10 Historias). Asigna ln-221-standards-researcher para la investigación de estándares. Patrón Decompose-First. Detecta automáticamente el equipo/Épica.

Investiga estándares/patrones a través de la Referencia MCP. Genera investigación de estándares para la subsección Notas Técnicas de la Historia. Trabajador reutilizable.

Accede a la Plataforma de Metabolómica del NIH mediante API REST (más de 4.200 estudios). Consulta metabolitos, nomenclatura RefMet, datos MS/NMR, búsquedas m/z, metadatos de estudios, para metabolómica y descubrimiento de biomarcadores.

Consulte la Plataforma de Objetivos Abiertos (Open Targets Platform) para asociaciones objetivo-enfermedad, descubrimiento de blancos de fármacos, datos de tractabilidad/seguridad, evidencia de genética/ómica y fármacos conocidos para la identificación de blancos terapéuticos.

Acceda a RCSB PDB para estructuras 3D de proteínas/ácidos nucleicos. Busque por texto/secuencia/estructura, descargue coordenadas (PDB/mmCIF), recupere metadatos, para biología estructural y descubrimiento de fármacos.

Diseñar casos de prueba completos usando PICT (Pruebas Combinatorias Independientes de Pares) para cualquier fragmento de requisitos o código. Analiza las entradas, genera modelos PICT con parámetros, valores y restricciones para escenarios válidos mediante pruebas de pares. Produce el modelo PICT, una tabla en markdown de los casos de prueba y los resultados esperados.

Generador integral de planificación y documentación de proyectos para proyectos de software. Crea documentos de requisitos estructurados, documentos de diseño del sistema y planes de desglose de tareas con seguimiento de implementación. Utilice cuando comience un nuevo proyecto, defina especificaciones, cree diseños técnicos o desglose sistemas complejos en tareas implementables. Soporta formato de historia de usuario, criterios de aceptación, diseño de componentes, especificaciones de API y descomposición jerárquica de tareas con trazabilidad de requisitos.