スクリプト
API はコードを読んで推測、マイグレーションは運任せ。
契約を先に書き、マイグレーションは事前にリハーサル。
このラインに 110 個のスキル
SNPと形質の関連性についてNHGRI-EBI GWASカタログをクエリー。rs ID、疾患/形質、遺伝子で変異を検索し、p値とサマリー統計量を取得することで、遺伝疫学および多遺伝子リスクスコアの研究に利用できる。
ヒト代謝産物データベース（22万種類以上の代謝産物）へのアクセス。名称/ID/構造で検索し、代謝組成学および同定のための化学的性質、バイオマーカーデータ、NMR/MSスペクトル、経路を取得できます。
KEGGへの直接REST APIアクセス（学術利用のみ）。経路解析、遺伝子-経路マッピング、代謝経路、薬物相互作用、ID変換。複数のデータベースを使用したPythonワークフローの場合は、bioservicesを推奨。直接HTTP/REST作業またはKEGG固有の制御にはこれを使用してください。
電子ラボノートAPI統合。ノートブックへのアクセス、エントリー/添付ファイルの管理、ノートブックのバックアップ、Protocols.io/Jupyter/REDCapとの統合、プログラムによるELNワークフローに対応。
このスキルは、生物学向けのオープンソースデータフレームワークであるLaminDBを使用する場合に利用します。LaminDBはデータをクエリ可能、追跡可能、再現可能、かつFAIRにするものです。生物学的データセット（scRNA-seq、空間的、フローサイトメトリーなど）の管理、計算ワークフローの追跡、生物学的オントロジーを使用したデータのキュレーションと検証、データレイクハウスの構築、または生物学的研究におけるデータの系統性と再現性の確保の場合に使用します。データ管理、アノテーション、オントロジー（遺伝子、細胞型、疾患、組織）、スキーマ検証、ワークフローマネージャー（Nextflow、Snakemake）およびMLOpsプラットフォーム（W&B、MLflow）との統合、ならびにデプロイ戦略を対象としています。
複数の学術データベース（PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholarなど）を使用して、包括的かつ体系的な文献レビューを実施する。このスキルは、生物医学、科学、技術分野における体系的文献レビュー、メタアナリシス、研究統合、または包括的文献検索を実施する場合に使用する。APA、Nature、Vancouverなどの複数の引用スタイルで確認された引用が付いた、プロフェッショナルな形式のMarkdown文書とPDFを作成する。
7つのプロジェクト文書（要件、アーキテクチャ、テックスタック、API仕様、データベーススキーマ、設計ガイドライン、ランブック）を作成および検証します。ln-110-documents-pipelineの4番目のワーカー。
テスト文書（testing-strategy.md + tests/README.md）を作成します。テスト方針とStory-Level Test Task Patternを確立します。ln-110-documents-pipelineワークフローの一部です。
Epicのストーリーを作成/再計画（5-10個のストーリー）。基準研究のためにln-221-standards-researcherに委任。Decompose-Firstパターン。チーム/Epicを自動発見。
MCP Ref.を介してリサーチ基準/パターンを調査します。ストーリー技術ノートのサブセクション向けの基準リサーチを生成します。再利用可能なワーカー。
markdown文書とチャットの要約を、どのデバイスでも読むことができるかKindleにアップロードできるフォーマット済みEPUB電子書籍ファイルに変換します。
SymPyを使用した決定論的な数学的計算。正確・検証済みの結果が必要なすべての数学的操作（基本演算、代数（簡約、展開、因数分解、方程式の解き方）、微積分（微分、積分、極限、級数）、線形代数（行列、行列式、固有値）、三角関数、整数論（素数、GCD/LCM、素因数分解）、統計学）に使用します。LLMの推定ではなくシンボル計算を使用することで数学的な正確性を確保します。
REST APIを介してNIHメタボロミクス・ワークベンチにアクセス（4,200件以上の研究）。メタボロミクスおよびバイオマーカー発見のために、代謝物、RefMet命名法、MS/NMRデータ、m/z検索、研究メタデータをクエリする。
ReplicateのFLUX 1.1 Proモデル用に最適化された、Midjourneyスタイルの高度に詳細な画像プロンプトを生成します。基本的なユーザーの説明を、専門的な写真品質、劇的な照明、編集的な美術性を備えた豊かなシネマティックなプロンプトに変換します。ユーザーが画像生成を要求したり、プロンプトの強化を必要としたり、FLUX 1.1 Proを介してMidjourney品質の出力を希望したりする場合に使用します。