⚙️ バックエンド

AlphaFoldの2億以上のAI予測タンパク質構造にアクセスできます。UniProt IDによって構造を取得し、PDB/mmCIFファイルをダウンロードし、薬剤発見および構造生物学のための信頼性指標（pLDDT、PAE）を分析します。

天文学および天体物理学のための総合的なPythonライブラリ。天体座標、物理単位、FITSファイル、宇宙論的計算、時間システム、テーブル、世界座標システム（WCS）、天文学的データ分析を含む天文学的データを扱う場合にこのスキルを使用してください。座標変換、単位変換、FITSファイルの操作、宇宙論的距離計算、時間尺度変換、または天文学的データ処理に関するタスクの場合に使用してください。

Node.js/Express/TypeScriptマイクロサービスの総合的なバックエンド開発ガイド。ルート、コントローラー、サービス、リポジトリ、ミドルウェアの作成時、またはExpress API、Prismaデータベースアクセス、Sentryエラートラッキング、Zodバリデーション、unifiedConfig、依存性注入、非同期パターンを使用する場合に使用します。レイヤードアーキテクチャ（ルート → コントローラー → サービス → リポジトリ）、BaseControllerパターン、エラーハンドリング、パフォーマンスモニタリング、テスト戦略、レガシーパターンからの移行について説明します。

Node.js、Express、Next.js の API ルート向けのバックエンドアーキテクチャパターン、API 設計、データベース最適化、サーバーサイドのベストプラクティスです。Node.js、Express、または Next.js の API ルートとそのデータアクセスを構築・レビューするときに使用します。

Benchling R&Dプラットフォームの統合。レジストリ（DNA、タンパク質）、在庫、ELNエントリー、ワークフローにAPI経由でアクセスし、Benchling Appsを構築し、Data Warehouseをクエリして、ラボデータ管理の自動化を行います。

分子生物学のための主要なPythonツールキット。PythonベースのPubMed/NCBIクエリ（Bio.Entrez）、配列操作、ファイル解析（FASTA、GenBank、FASTQ、PDB）、高度なBLASTワークフロー、構造、系統発生学に適している。クイックBLASTにはggetを使用。直接REST APIにはpubmed-databaseを使用。

bioRxivプリントサーバー用の効率的なデータベース検索ツール。キーワード、著者、日付範囲、カテゴリーで生命科学プリントを検索する場合、論文のメタデータを取得する場合、PDFをダウンロードする場合、または文献レビューを行う場合にこのスキルを使用します。

40以上のバイオインフォマティクスサービスのプライマリPythonツール。UniProt、KEGG、ChEMBL、PubChem、Reactome、QuickGOといったマルチデータベースワークフローに推奨。クエリ、IDマッピング、パスウェイ解析のための統合API。直接REST制御する場合は、個々のデータベーススキル（uniprot-database、kegg-database）を使用してください。

ChEMBLの生物活性分子および創薬データを問い合わせる。構造・特性によって化合物を検索し、生物活性データ（IC50、Ki）を取得し、阻害剤を探し、医薬化学のためにSAR研究を行う。

API v2を介してClinicalTrials.govをクエリーします。状態、薬物、位置、ステータスまたはフェーズで試験を検索します。臨床研究および患者マッチングのために、NCT IDにより試験の詳細を取得し、データをエクスポートします。

Access ClinPGx薬物ゲノミクスデータ（PharmGKBの後継）。個別化医療および遺伝子型に基づく投与量決定のために、遺伝子と薬剤の相互作用、CPICガイドライン、対立遺伝子の機能をクエリします。

変異の臨床的意義のためにNCBI ClinVarをクエリーします。遺伝子/位置によって検索し、病原性分類を解釈し、E-utilities APIまたはFTP経由でアクセスし、ゲノム医学のためにVCFを注釈します。

ファイル間で行単位の精度でコードを転送します。ユーザーがある場所から別の場所にコードをコピーする、ファイル間で関数やクラスを移動する、コードブロックを抽出する、または特定の行番号にコードを挿入することを要求した場合に使用します。

COSMICがん突然変異データベースにアクセスします。がん研究および精密腫瘍学のため、体細胞突然変異、Cancer Gene Census、突然変異シグネチャ、遺伝子融合をクエリします。認証が必要です。

エンジニアリングチームに対する技術的なリーダーシップのガイダンス、アーキテクチャの決定、およびテクノロジー戦略。テックデブトアナライザー、チーム拡張計算機、エンジニアリング指標フレームワーク、テクノロジー評価ツール、およびADRテンプレートが含まれます。テクニカルデブトの評価、エンジニアリングチームの拡張、テクノロジーの評価、アーキテクチャの決定、エンジニアリング指標の確立を行う場合、またはユーザーがCTO、テックデブト、テクニカルデブト、チーム拡張、アーキテクチャの決定、テクノロジー評価、エンジニアリング指標、DORA指標、またはテクノロジー戦略に言及した場合に使用します。

MongoDB（ドキュメントデータベース、BSONドキュメント、アグリゲーションパイプライン、Atlasクラウド）およびPostgreSQL（リレーショナルデータベース、SQLクエリ、psql CLI、pgAdmin）を使用します。データベーススキーマの設計、クエリとアグリゲーションの作成、パフォーマンスのためのインデックスの最適化、データベースの移行の実行、レプリケーションとシャーディングの構成、バックアップおよびリストア戦略の実装、データベースユーザーと権限の管理、クエリパフォーマンスの分析、またはプロダクションデータベースの管理を行う場合に使用します。

DrugBankデータベースから、薬物の特性、相互作用、標的、経路、化学構造、薬理データを含む総合的な薬物情報にアクセスし、分析します。この機能は、製薬データの処理、創薬研究、薬理学研究、薬物間相互作用分析、標的の同定、化学的類似性検索、ADMET予測、またはDrugBankから詳細な薬物および薬物標的情報を必要とする任意のタスクで使用される必要があります。

API/FTPを介して欧州ヌクレオチドアーカイブにアクセスできます。アクセッション番号によりDNA/RNA配列、生リード（FASTQ）、ゲノムアセンブリを取得し、ゲノミクスおよびバイオインフォマティクスのパイプラインに利用できます。複数のフォーマットに対応しています。

250種以上の種のEnsemblゲノムデータベースREST APIをクエリーします。ゲノム研究のための遺伝子検索、配列取得、バリアント解析、比較ゲノミクス、オルソログ、VEP予測。

系統発生樹ツールキット（ETE）。ツリー操作（Newick/NHX）、進化事象検出、オルソロジー/パラロジー、NCBI分類法、可視化（PDF/SVG）、系統ゲノミクス用。

FDAの規制データ分析および安全性研究のため、薬物、医療機器、有害事象、回収、規制申請（510k、PMA）、物質識別（UNII）に関するopenFDA APIをクエリします。

機能リクエストを、明確なタスクを持つ詳細で実装可能な計画に分解する。ユーザーが新機能、機能強化、または複雑な変更を要求した場合に使用する。

このスキルは、figletタグを含むファイルを処理し、それをASCIIアート表現に置き換えます。コメントスタイル（//、#、--、/*）を検出して保持し、Node.jsの依存関係を自動的に管理し、400以上のフォントをサポートします（デフォルトは標準フォント）。このスキルは、ユーザーがfigletタグ構文を使用してファイル内のマークされたテキストをASCIIアートに変換することを要求した場合、または利用可能なフォントを一覧表示したい場合に使用されるべきです。

E-utilities/Datasets API を介して NCBI Gene をクエリします。シンボル/ID で検索し、遺伝子情報（RefSeqs、GO、位置、表現型）を取得し、バッチ検索を行い、遺伝子アノテーションおよび機能解析を行います。