💻 Développement

Cadre d'agent AI biomédical autonome pour l'exécution de tâches de recherche complexes dans les domaines de la génomique, de la découverte de médicaments, de la biologie moléculaire et de l'analyse clinique. Utilisez cette compétence lors de la conduite de recherches biomédicales à plusieurs étapes, y compris la conception de criblages CRISPR, l'analyse RNA-seq à cellule unique, la prédiction ADMET, l'interprétation des GWAS, le diagnostic de maladies rares ou l'optimisation des protocoles de laboratoire. Exploite le raisonnement LLM avec exécution de code et bases de données biomédicales intégrées.

Expert sur Claude Code CLI, compétences, commandes, hooks, plugins, MCP, paramètres et flux de travail. Se déclenche sur claude code, cli, skill, command, hook, plugin, mcp, slash command, settings

Expert sur la configuration du fichier settings.json de Claude Code, les permissions, le bac à sable, les variables d'environnement et la hiérarchie des paramètres. Se déclenche lorsque l'utilisateur mentionne settings.json, permissions, règles d'autorisation, règles d'interdiction, bac à sable, configuration des hooks ou priorité des paramètres.

Gestion de l'outil CLI pour les agents de codage. Cette compétence doit être utilisée lorsque : - Une commande échoue avec l'erreur « command not found » ou des erreurs similaires - L'utilisateur demande d'installer, mettre à jour ou vérifier des outils CLI - Un projet nécessite une configuration de l'environnement ou une vérification des dépendances - Des outils sont manquants, obsolètes ou nécessitent une réconciliation Fournit l'autoinstallation de plus de 74 outils via des gestionnaires de paquets optimaux, l'audit de l'environnement du projet et les capacités de mise à jour par lots.

Docking moléculaire basé sur la diffusion. Prédiction des conformations de liaison protéine-ligand à partir de PDB/SMILES, scores de confiance, criblage virtuel, pour la conception de médicaments basée sur la structure. Non pour la prédiction d'affinité.

Plateforme cloud de génomique DNAnexus. Créer des applications/applets, gérer des données (téléchargement/téléversement), SDK Python dxpy, exécuter des workflows, FASTQ/BAM/VCF, pour le développement et l'exécution de pipelines génomiques.

Documentation FrankenPHP - Serveur d'applications PHP moderne construit sur Caddy

Plateforme Latch pour les workflows bioinformatiques. Créez des pipelines avec le Latch SDK, les décorateurs @workflow/@task, déployez des workflows serverless, LatchFile/LatchDir, intégration Nextflow/Snakemake.

Cette compétence orchestre la création d'un système de documentation complet en invoquant 6 travailleurs spécialisés en documentation dans l'ordre. Chaque travailleur s'occupe d'un domaine (racine/référence/tâches/projet/presentation/test) et valide sa propre sortie, éliminant le couplage Travailleur→Travailleur. Cette compétence devrait être...

Effectue des tests manuels de Story AC (API/UI) avec curl/puppeteer, documente les résultats dans Linear (commentaire structuré) et fournit des scripts réutilisables. Worker seulement.

Planifie l’activité de test des histoires selon le test basé sur le risque après le test manuel. Calcule les priorités, sélectionne E2E/Intégration/Unité, délègue à ln-311-task-creator. Invoqué par ln-340-story-quality-gate.

Testez les routes authentifiées de votre projet à l'aide de l'authentification basée sur les cookies. Utilisez cette compétence lors de l'essai des points de terminaison API, de la validation de la fonctionnalité des routes ou du débogage des problèmes d'authentification. Inclut les modèles d'utilisation de test-auth-route.js et d'authentification mock.

Expert Supabase complet avec accès à 2 616 fichiers de documentation officiels couvrant la base de données PostgreSQL, l'authentification, les abonnements en temps réel, le stockage, les fonctions edge, les embeddings vectoriels et toutes les fonctionnalités de la plateforme. Invoker lorsque l'utilisateur mentionne Supabase, PostgreSQL, base de données, auth, temps réel, stockage, fonctions edge, backend-as-a-service ou pgvector.

Évaluez les extensions TYPO3 pour leur conformité aux normes TYPO3 12/13 LTS, aux lignes directrices de codage (PSR-12) et aux modèles d'architecture. Utilisez-le lors de l'évaluation de la qualité des extensions, de la génération de rapports de conformité, de l'identification de dettes techniques ou de la planification de modernisation. Valide : architecture de l'extension, composer.json, ext_emconf.php, fichiers ext_*, dépréciations v13, conformité du module backend v13 (modules ES6, DocHeader, APIs Modal/Notification, mise en page Module.html, ARIA, cohérence de la clé d'extension, CSRF, icônes), injection de dépendances, services, tests, modèles Extbase, Crowdin, workflows GitHub. Notation double (0-100 base + 0-22 excellence). Délègue aux compétences typo3-tests et typo3-docs pour une analyse approfondie. Prise en charge de PHP 8.1-8.4.

Guidez les contributeurs à travers le flux de travail de contribution complet au cœur TYPO3, depuis la configuration du compte jusqu'à la soumission de patches pour les contributions de code et de documentation. Déclenchez lorsque : vous travaillez avec les problèmes TYPO3 Forge (forge.typo3.org/issues/*), préparez des patches pour le cœur TYPO3, contribuez à TYPO3 (code ou documentation), soumettez des patches à Gerrit (review.typo3.org) ou à des PR GitHub (TYPO3-Documentation/*), corrigez des bugs TYPO3, gérez l'état WIP ou déboguez des échecs CI. Couvre : configuration du compte, configuration de l'environnement avec DDEV, formatage des messages de commit, flux de travail de révision Gerrit, flux de travail de PR GitHub pour la documentation, gestion de l'état WIP (ligne de commande et interface web), débogage CI/CD (CGL, PHPStan, tests unitaires), dépannage (plus de 60 scénarios), application de la qualité du code et soumission systématique de patches pour les dépôts de code et de documentation.

Automatise la configuration de l'environnement DDEV pour le développement d'extensions TYPO3. Utilisez-le lors de la configuration d'un environnement de développement local, de la configuration de DDEV pour les extensions TYPO3 ou de la création d'environnements de test TYPO3 multi-versions. Couvre : génération de configuration DDEV, installation de TYPO3 11.5/12.4/13.4 LTS, commandes DDEV personnalisées, configuration de vhost Apache, gestion des volumes Docker et bonnes pratiques pour .gitignore (évitez le motif anti-pattern de double ignore). Fournit une automatisation complète, du détection des métadonnées à l'accès prêt à l'emploi au backend TYPO3.

Créez, configurez et gérez des tests d'extensions TYPO3 (unitaires, fonctionnels, d'acceptation) en suivant les modèles du framework de test officiel TYPO3. Utilisez-le lors de la configuration des tests, de l'écriture des cas de test, de la configuration de PHPUnit, de la gestion des fixtures ou de l'intégration de pipelines CI/CD pour les extensions TYPO3. Couvre PHPUnit 11/12, TYPO3 v12/v13 LTS, les modèles modernes de test d'injection de dépendances et des outils de qualité complets (PHPStan niveau 10, Rector, php-cs-fixer).