⚙️ Backend

Greifen Sie auf über 200 Millionen durch KI vorhergesagte Proteinstrukturen von AlphaFold zu. Abrufen von Strukturen per UniProt-ID, Herunterladen von PDB/mmCIF-Dateien, Analyse von Zuverlässigkeitsmetriken (pLDDT, PAE) für die Arzneimittelforschung und Strukturbiologie.

Umfassende Python-Bibliothek für Astronomie und Astrophysik. Diese Fähigkeit sollte verwendet werden, wenn mit astronomischen Daten gearbeitet wird, einschließlich HIMMELSKOORDINATEN, PHYSIKALISCHEN EINHEITEN, FITS-Dateien, KOSMOLOGISCHEN BERECHNUNGEN, ZEITSYSTEMEN, TABELLEN, WELTKOORDINATENSYSTEMEN (WCS) und ASTRONOMISCHER DATENANALYSE. Verwenden Sie sie bei Aufgaben, die KOORDINATUMWANDLUNGEN, EINHEITENKONVERSIONS, FITS-DATEI-MANIPULATION, KOSMOLOGISCHE ABSTANDSBERECHNUNGEN, ZEITSKALENKONVERSIONS oder ASTRONOMISCHE DATENVERARBEITUNG umfassen.

Umfassender Backend-Entwicklungsleitfaden für Node.js/Express/TypeScript-Mikroservices. Verwenden Sie ihn bei der Erstellung von Routen, Controllern, Diensten, Repositories, Middleware oder bei der Arbeit mit Express-APIs, Prisma-Datenbankzugriff, Sentry-Fehlerverfolgung, Zod-Validierung, unifiedConfig, Dependency Injection oder asynchronen Mustern. Deckt die geschichtete Architektur (Routen → Controller → Dienste → Repositories), das BaseController-Muster, Fehlerbehandlung, Performancemonitoring, Teststrategien und die Migration von Legacy-Mustern ab.

Backend-Architekturmuster, API-Design, Datenbankoptimierung und serverseitige Best Practices für Node.js-, Express- und Next.js-API-Routen. Verwenden Sie es beim Erstellen oder Überprüfen von Node.js-, Express- oder Next.js-API-Routen und deren Datenzugriff.

Integration der Benchling-Forschungs- und Entwicklungsplattform. Zugriff auf Register (DNA, Proteine), Bestände, ELN-Einträge, Workflows über API, Erstellen von Benchling-Apps, Abfragen des Data Warehouses zur Automatisierung des Labordatamanagements.

Primäres Python-Toolkit für Molekularbiologie. Bevorzugt für Python-basierte PubMed/NCBI-Abfragen (Bio.Entrez), Sequenzmanipulation, Dateiparsing (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), fortgeschrittene BLAST-Arbeitsabläufe, Strukturen, Phylogenetik. Für schnelle BLAST-Abfragen verwenden Sie gget. Für direkte REST-API verwenden Sie pubmed-database.

Effizientes Datenbank-Suchtool für den bioRxiv-Vorabdruckserver. Verwenden Sie diese Fähigkeit bei der Suche nach Preprints aus den Lebenswissenschaften nach Schlüsselwörtern, Autoren, Datumsbereichen oder Kategorien, bei der Abfrage von Papier-Metadaten, dem Herunterladen von PDFs oder der Durchführung von Literaturrecherchen.

Primäres Python-Tool für über 40 Bioinformatik-Services. Bevorzugt für Multidatenbank-Workflows: UniProt, KEGG, ChEMBL, PubChem, Reactome, QuickGO. Einheitliche API für Abfragen, ID-Zuordnung, Pfadway-Analyse. Für direkte REST-Steuerung nutzen Sie individuelle Datenbankfähigkeiten (uniprot-database, kegg-database).

Abfrage von bioaktiven Molekülen und Arzneimittelforschungsdaten in ChEMBL. Suchen von Verbindungen nach Struktur/Eigenschaften, Abrufen von Bioaktivitätsdaten (IC50, Ki), Finden von Inhibitoren, Durchführen von SAR-Studien für die medizinische Chemie.

Abfragen von ClinicalTrials.gov über API v2. Durchsuchen von Studien nach Indikation, Arzneimittel, Standort, Status oder Phase. Abrufen von Studiendetails per NCT-ID, Exportieren von Daten für klinische Forschung und Patientenzuordnung.

Zugriff auf ClinPGx-Pharmacogenomics-Daten (Nachfolger von PharmGKB). Abfragen von Gen-Medikament-Interaktionen, CPIC-Leitlinien, Allelfunktionen für Präzisionsmedizin und Genotyp-gesteuerte Dosierungsentscheidungen.

Abfrage von NCBI ClinVar nach klinischer Signifikanz von Varianten. Suchen nach Gen/Position, Interpretieren von Pathogenitätsklassifikationen, Zugriff über die E-utilities-API oder FTP, Annotation von VCFs für die Genommedizin.

Übertragen Sie Code zwischen Dateien mit zeilenweiser Präzision. Verwenden Sie dies, wenn Benutzer anfordern, Code von einem Ort zu einem anderen zu kopieren, Funktionen oder Klassen zwischen Dateien zu verschieben, Codeblöcke zu extrahieren oder Code an bestimmten Zeilennummern einzufügen.

Zugriff auf die COSMIC-Krebsmutationendatenbank. Abfrage von somatischen Mutationen, Cancer Gene Census, Mutationssignaturen, Genfusionen für Krebsforschung und Präzisionsonkologie. Erfordert Authentifizierung.

Technische Leitungsanweisungen für Engineering-Teams, Architekturentscheidungen und Technologie-Strategie. Beinhaltet Tech-Debt-Analysator, Team-Skalierungsrechner, Engineering-Metriken-Frameworks, Technologie-Evaluierungstools und ADR-Vorlagen. Verwenden Sie es bei der Bewertung von Tech-Debt, der Skalierung von Engineering-Teams, der Evaluierung von Technologien, der Treffen von Architekturentscheidungen, der Festlegung von Engineering-Metriken oder wenn der Nutzer CTO, Tech Debt, technical debt, Team-Skalierung, Architekturentscheidungen, Technologie-Evaluierung, Engineering-Metriken, DORA-Metriken oder Technologie-Strategie erwähnt.

Arbeite mit MongoDB (Dokumentendatenbank, BSON-Dokumente, Aggregationspipelines, Atlas Cloud) und PostgreSQL (relationale Datenbank, SQL-Abfragen, psql-CLI, pgAdmin). Verwende es bei der Designung von Datenbankschemata, der Erstellung von Abfragen und Aggregationen, der Optimierung von Indizes für Leistung, der Durchführung von Datenbankmigrations, der Konfiguration von Replikation und Sharding, der Implementierung von Sicherungs- und Wiederherstellungsstrategien, der Verwaltung von Datenbankbenutzern und -berechtigungen, der Analyse der Abfrageleistung oder der Verwaltung von Produktionsdatenbanken.

Zugriff auf und Analyse umfassender Arzneimittelinformationen aus der DrugBank-Datenbank, einschließlich Arzneimiteleigenschaften, Wechselwirkungen, Ziele, Wege, chemische Strukturen und Pharmakologiedaten. Diese Fähigkeit sollte bei der Arbeit mit pharmazeutischen Daten, Arzneimittelforschungsforschungen, Pharmakologiestudien, Arzneimittel-Arzneimittel-Wechselwirkungsanalysen, Zielidentifizierung, chemischen Ähnlichkeitssuchen, ADMET-Vorhersagen oder bei jeder Aufgabe verwendet werden, die detaillierte Arzneimittel- und Arzneimittelzielinformationen aus der DrugBank erfordert.

Greifen Sie auf das European Nucleotide Archive über API/FTP zu. Abrufen von DNA/RNA-Sequenzen, Rohdatenreads (FASTQ) und Genomassemblierungen per Zugriffsnummer für Genomik- und Bioinformatik-Pipelines. Unterstützt multiple Formate.

Abfrage der Ensembl-Genomedatenbank REST-API für über 250 Arten. Gen-Suchen, Sequenzabfrage, Variantenanalyse, vergleichende Genomik, Orthologe, VEP-Vorhersagen für die Genomforschung.

Phylogenetischer Baum-Toolkit (ETE). Baummanipulation (Newick/NHX), Detektion evolutiver Ereignisse, Orthologie/Paralogie, NCBI-Taxonomie, Visualisierung (PDF/SVG) für Phylogenomik.

Fragen Sie die openFDA-API nach Medikamenten, Geräten, unerwünschten Ereignissen, Rückrufen, regulatorischen Einreichungen (510k, PMA) und Substanzidentifizierung (UNII) für FDA-Regulierungsdatenanalyse und Sicherheitsforschung.

Zerlegen Sie Funktionsanfragen in detaillierte, implementierbare Pläne mit klaren Aufgaben. Verwenden Sie dies, wenn der Nutzer eine neue Funktion, eine Verbesserung oder eine komplexe Änderung anfordert.

Diese Fähigkeit verarbeitet Dateien mit Figlet-Tags und ersetzt sie durch ASCII-Art-Darstellungen. Sie erkennt und bewahrt Kommentastyle (Doppel-Schrägstrich, Raute, Doppel-Geviertstrich, Schrägstrich-Stern) auf, verwaltet Node.js-Abhängigkeiten automatisch und unterstützt über 400 Schriftarten (Standard ist die Standard-Schriftart). Die Fähigkeit sollte verwendet werden, wenn ein Nutzer die Umwandlung von markiertem Text in einer Datei in ASCII-Art unter Verwendung von Figlet-Tag-Syntax anfordert oder wenn er verfügbare Schriftarten auflisten möchte.

Abfrage von NCBI Gene über E-utilities/Datasets API. Suchen nach Symbol/ID, Abrufen von Geninformationen (RefSeqs, GO, Lokalisationen, Phänotypen), Batch-Suchanfragen für Genannotation und Funktionsanalyse.