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使用OpenAlex数据库查询和分析学术文献。当搜索学术论文、分析研究趋势、查找作者或机构的作品、追踪引用、发现开放获取出版物或对24000万余篇学术作品进行文献计量分析时，应使用此技能。用于文献检索、研究产出分析、引用分析和学术数据库查询。

查询Open Targets平台以获取靶点-疾病关联、药物靶点发现、可成药性/安全性数据、遗传学/组学证据和已知药物，用于治疗靶点识别。

用于分析全切片图像（WSI）和多参数成像数据的计算病理学工具包。在处理组织病理学切片、H&E染色图像、多重免疫荧光（CODEX、Vectra）、空间蛋白质组学、细胞核检测/分割、组织图构建或在病理学数据上训练机器学习模型时，请使用此技能。支持160多种切片格式，包括用于数字病理学工作流的Aperio SVS、NDPI、DICOM、OME-TIFF。

访问RCSB PDB获取3D蛋白质/核酸结构。通过文本/序列/结构进行搜索，下载坐标（PDB/mmCIF），检索元数据，用于结构生物学和药物发现。

通过LiteLLM和OpenRouter使用Perplexity模型进行AI驱动的实时信息网络搜索。当需要进行当前信息的网络搜索、查找最新科学文献、获得带来源引用的可靠答案或访问超出模型知识截止日期的信息时，应使用此技能。通过单一OpenRouter API密钥即可访问多种Perplexity模型，包括Sonar Pro、Sonar Pro Search（高级智能体搜索）和Sonar Reasoning Pro。

使用PICT（成对独立组合测试）为任何需求或代码设计全面的测试用例。分析输入，使用成对测试生成包含参数、值和有效场景约束的PICT模型。输出PICT模型、测试用例的Markdown表格以及预期结果。

适用于Python的交互式科学和统计数据可视化库。创建图表、绘图或可视化（包括散点图、折线图、柱状图、热力图、3D绘图、地理地图、统计分布、金融图表和仪表板）时使用。支持快速可视化（Plotly Express）和细粒度自定义（图形对象）。输出交互式HTML或静态图像（PNG、PDF、SVG）。

基于 Apache Arrow 的快速 DataFrame 库。提供选择、过滤、分组、连接、惰性计算、CSV/Parquet 输入输出、表达式 API，适用于高性能数据分析工作流。

面向产品负责人的战略产品领导力工具包，包含 OKR 逐级分解生成、市场分析、愿景设定和团队扩容功能。用于战略规划、目标对齐、竞争分析和组织设计。

软件项目的全面项目规划和文档生成器。用于创建结构化需求文档、系统设计文档以及带有实施跟踪的任务分解计划。在启动新项目、定义规格、创建技术设计或将复杂系统分解为可实施任务时使用。支持用户故事格式、验收标准、组件设计、API 规格以及带有需求可追溯性的分层任务分解。

在编写代理的命令、钩子、技能或为子代理或任何其他LLM交互编写提示时，包括优化提示、改进LLM输出或设计生产级提示模板，请使用此技能。

通过PUG-REST API/PubChemPy查询PubChem（1.1亿+化合物）。通过名称/CID/SMILES搜索，检索化学信息学的性质、相似度/子结构搜索、生物活性。

对PubMed的直接REST API访问。高级布尔/MeSH查询、E-utilities API、批处理、引文管理。对于Python工作流，推荐使用biopython（Bio.Entrez）。将此用于直接HTTP/REST工作或自定义API实现。

材料科学工具包。用于计算材料科学的晶体结构（CIF、POSCAR）、相图、能带结构、DOS、材料项目集成、格式转换。

使用PyMC进行贝叶斯建模。构建分层模型、MCMC（NUTS）、变分推断、LOO/WAIC比较、后验检查，用于概率编程和推断。

多目标优化框架。NSGA-II、NSGA-III、MOEA/D、帕累托前沿、约束处理、基准测试（ZDT、DTLZ），用于工程设计和优化问题。

基因组文件工具包。用于NGS数据处理流程，可读写SAM/BAM/CRAM比对文件、VCF/BCF变异文件、FASTA/FASTQ序列文件，提取区域，计算覆盖度。

治疗学数据共享平台。用于治疗机器学习和药理学预测的AI就绪药物发现数据集（ADME、毒性、DTI）、基准测试、骨架分割、分子预言机。

用于构建、优化和执行量子电路的综合量子计算工具包。在使用量子算法、模拟或量子硬件时使用，包括：（1）使用门和测量构建量子电路；（2）运行量子算法（VQE、QAOA、Grover）；（3）为硬件转译/优化电路；（4）在IBM Quantum或其他提供商上执行；（5）量子化学和材料科学；（6）量子机器学习；（7）可视化电路和结果；或（8）任何量子计算开发任务。

用于精细分子控制的化学信息学工具包。支持 SMILES/SDF 解析、分子描述符（分子量、LogP、TPSA）、分子指纹、子结构搜索、2D/3D 生成、相似性比较和化学反应。对于具有更简单界面的标准工作流，请使用 datamol（RDKit 的包装器）。对于高级控制、自定义净化和专用算法，请使用 rdkit。

为系统生物学研究查询Reactome REST API以获取通路分析、富集、基因-通路映射、疾病通路、分子相互作用和表达分析结果。

PDF生成工具包。用于创建发票、报告、证书、表单、图表、表格、条形码、二维码，提供Canvas/Platypus API，适用于专业文档自动化。

单细胞RNA-seq分析。加载.h5ad/10X数据、质量控制、归一化、PCA/UMAP/t-SNE、 Leiden聚类、标记基因、细胞类型注释、轨迹用于scRNA-seq分析。

统计可视化。用于探索性分析和 publication figures 的散点图、箱线图、小提琴图、热图、配对图、回归图、相关矩阵、核密度估计图、分面图。