⚙️ 后端开发

查询NHGRI-EBI GWAS Catalog以获取SNP与性状的关联。通过rs ID、疾病/性状、基因搜索变异，检索p值和汇总统计数据，用于遗传流行病学和多基因风险评分。

用于全切片图像（WSI）的数字病理图像处理工具包。在处理组织病理切片、H&E或IHC染色组织图像、从千兆像素病理图像提取瓦片、检测组织区域、分割组织掩码或为计算病理深度学习管道准备数据集时使用此技能。适用于WSI格式（SVS、TIFF、NDPI）、基于瓦片的分析和组织学图像预处理工作流。

访问人类代谢组数据库（220K+代谢物）。通过名称/ID/结构搜索，检索用于代谢组学和鉴定的化学性质、生物标志物数据、NMR/MS光谱、通路。

仅用于学术用途的KEGG直接REST API访问。通路分析、基因通路映射、代谢通路、药物相互作用、ID转换。对于涉及多个数据库的Python工作流，首选bioservices。将此用于直接HTTP/REST工作或KEGG特定控制。

电子实验室笔记本 API 集成。访问笔记本、管理条目/附件、备份笔记本，与 Protocols.io/Jupyter/REDCap 集成，用于程序化 ELN 工作流。

这个技能应用于LaminDB——一款为生物学领域开发的开源数据框架，可让数据可查询、可追溯、可重现且符合FAIR原则。当您需要管理生物数据集（scRNA-seq、空间、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物本体论整理和验证数据、构建数据湖仓，或确保生物研究中的数据 lineage 和可重现性时，请使用此技能。涵盖数据管理、注释、本体论（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理器（Nextflow、Snakemake）和MLOps平台（W&B、MLflow）的集成，以及部署策略。

Linode API 文档

使用多个学术数据库（PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等）进行全面、系统的文献综述。该技能适用于在生物医学、科学和技术领域开展系统文献综述、荟萃分析、研究合成或全面文献检索时使用。创建专业格式的 markdown 文档和 PDF，包含多种引用格式（APA、Nature、Vancouver等）的验证引用。

创建并验证7个项目文档（需求、架构、技术栈、API规范、数据库 schema、设计指南、运行手册）。ln-110-文档-流水线的第四个工作节点。

生成测试文档（testing-strategy.md + tests/README.md）。确立测试理念和用户故事级测试任务模式。ln-110-documents-pipeline 工作流程的一部分。

根据范围创建/重新规划 Epics（3-7 个 Epics）。批量预览 + 自动提取。先分解模式。自动发现团队 ID。

[zh] CREATE/REPLAN Stories for Epic (5-10 Stories). Delegates ln-221-standards-researcher for standards research. Decompose-First Pattern. Auto-discovers team/Epic.

通过MCP参考研究标准/模式。为故事技术说明子部分生成标准研究。可复用工作人员。

将Markdown文档和聊天摘要转换为格式化的EPUB电子书文件，可在任何设备上阅读或上传至Kindle。

质谱分析。处理mzML/MGF/MSP，光谱相似性（余弦、修正余弦），元数据协调，化合物鉴定，用于代谢组学和质谱数据处理。

使用SymPy进行确定性数学计算。可用于任何需要精确/验证结果的数学运算——基础算术、代数（化简、展开、因式分解、解方程）、微积分（导数、积分、极限、级数）、线性代数（矩阵、行列式、特征值）、三角学、数论（质数、GCD/LCM、因式分解）和统计学。通过使用符号计算而非LLM估计来确保数学准确性。

基础绘图库。创建折线图、散点图、柱状图、直方图、热力图、3D 图、子图，导出 PNG/PDF/SVG，用于科学可视化和出版物图表。

通过REST API访问NIH代谢组学工作台（4200多项研究）。查询代谢物、RefMet命名法、MS/NMR数据、m/z搜索、研究元数据，用于代谢组学和生物标志物发现。

生成针对Replicate上FLUX 1.1 Pro模型优化的、高度详细的Midjourney风格图像提示。将基础用户描述转化为具有专业摄影品质、戏剧化光线和编辑级美感的丰富电影感提示。在用户请求图像生成、需要提示优化或希望通过FLUX 1.1 Pro获得Midjourney质量输出时使用。

使用无服务器容器、GPU 和自动缩放功能在云端运行 Python 代码。可用于部署机器学习模型、运行批处理作业、调度计算密集型任务，或提供需要 GPU 加速或动态缩放的 API。

用于机器学习的分子特征化（100+ 种特征化器）。ECFP、MACCS、描述符、预训练模型（ChemBERTa），将SMILES转换为特征，用于QSAR和分子机器学习。

N8N 文档 - 具备 AI 功能的工作流自动化平台

Ollama API 文档

显微镜数据管理平台。通过 Python 访问图像、检索数据集、分析像素、管理 ROI/注释、批量处理，用于高内容筛选和显微镜工作流程。