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PathML

用于分析全切片图像(WSI)和多参数成像数据的计算病理学工具包。在处理组织病理学切片、H&E染色图像、多重免疫荧光(CODEX、Vectra)、空间蛋白质组学、细胞核检测/分割、组织图构建或在病理学数据上训练机器学习模型时,请使用此技能。支持160多种切片格式,包括用于数字病理学工作流的Aperio SVS、NDPI、DICOM、OME-TIFF。

⚙️ Backend✦付费剧本✦7 种语言

你将成为

使用场景

适用于以下场景

✦ 01🧬

微生物组多样性分析

计算 alpha/beta 多样性指标并可视化微生物群落结构

✦ 02🌳

系统发育树构建

使用 Newick 格式数据构建和分析进化关系

✦ 03📊

生态排序绘图

执行主坐标分析 (PCoA) 和 PERMANOVA,以探索生物数据集中的模式

✦ 04🔍

序列比对处理

导入、分析和操作 FASTA 序列,用于比较基因组学

装备后的数字

为什么选择这个技能

经过验证的优势和可衡量的影响

80%

更快的多样性计算

使用经过优化的 scikit-bio 算法来精简 Alpha/Beta 多样性分析

5x

快速系统发育工作流

通过集成工具加速树的构建与可视化

70%

减少数据预处理

利用统一的输入/输出功能,简化复杂的微生物组数据处理

装备内容

里面有什么

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重启 Claude 或运行重载命令,skill 会自动加载。
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提示: 首次使用前请阅读文档与代码,确认它的功能和所需权限。

相关标签

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技术信息

作者
K-Dense-AI
分类
Backend
文件大小
7.25 KB
来源仓库
K-Dense-AI__claude-scientific-skills
许可证
MIT
元数据
包含 YAML 元数据
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伊恩

高级

该技能适用于时间序列机器学习任务,包括分类、回归、聚类、预测、异常检测、分割和相似性搜索。当处理时间数据、序列模式或需要标准机器学习方法之外的专用算法的时间索引观测值时使用。特别适合具有scikit-learn兼容API的单变量和多变量时间序列分析。

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Anndata

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这个技能应在使用Python处理带注释的数据矩阵时使用,尤其是在单细胞基因组学分析、使用元数据管理实验测量或处理大规模生物数据集时。当任务涉及AnnData对象、h5ad文件、单细胞RNA-seq数据或与scanpy/scverse工具集成时使用。

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按照公开的agents.md规范生成并维护AGENTS.md文件。在为AI代理工作流创建文档、编写入职指南或在项目间标准化代理交互模式时使用。

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