⚙️ 后端开发

访问AlphaFold的2亿多个AI预测蛋白质结构。通过UniProt ID检索结构，下载PDB/mmCIF文件，分析置信度指标（pLDDT、PAE），用于药物发现和结构生物学研究。

用于天文学和天体物理学的综合Python库。当处理包括天球坐标、物理单位、FITS文件、宇宙学计算、时间系统、表格、世界坐标系统（WCS）和天文数据分析在内的天文数据时，应使用此技能。当任务涉及坐标转换、单位转换、FITS文件操作、宇宙学距离计算、时间尺度转换或天文数据处理时使用。

Node.js/Express/TypeScript 微服务的全面后端开发指南。在创建路由、控制器、服务、存储库、中间件，或使用 Express API、Prisma 数据库访问、Sentry 错误跟踪、Zod 验证、unifiedConfig、依赖注入或异步模式时使用。涵盖分层架构（路由→控制器→服务→存储库）、BaseController 模式、错误处理、性能监控、测试策略以及从遗留模式迁移。

Benchling研发平台集成。通过API访问注册库（DNA、蛋白质）、库存、ELN条目、工作流，构建Benchling应用，查询数据仓库，用于实验室数据管理自动化。

用于分子生物学的主要Python工具包。是基于Python的PubMed/NCBI查询（Bio.Entrez）、序列操作、文件解析（FASTA、GenBank、FASTQ、PDB）、高级BLAST工作流程、结构和系统发育学的首选工具。快速BLAST请使用gget。直接使用REST API请使用pubmed-database。

40多种生物信息学服务的主要Python工具。是UniProt、KEGG、ChEMBL、PubChem、Reactome、QuickGO等多数据库工作流的首选。提供用于查询、ID映射、通路分析的统一API。如需直接REST控制，请使用各数据库技能（uniprot-database、kegg-database）。

查询ChEMBL的生物活性分子和药物发现数据。按结构/性质搜索化合物，检索生物活性数据（IC50、Ki），查找抑制剂，进行SAR研究，用于药物化学。

为工程团队提供技术领导力指导、架构决策和技术战略。包含技术债务分析器、团队规模计算器、工程指标框架、技术评估工具和ADR模板。适用于评估技术债务、扩大工程团队规模、评估技术、制定架构决策、建立工程指标的场景，或当用户提及CTO、技术债务、团队扩张、架构决策、技术评估、工程指标、DORA指标或技术战略时使用。

通过API/FTP访问欧洲核苷酸档案库。通过登录号检索DNA/RNA序列、原始读数（FASTQ）、基因组组装，用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。

查询250多种物种的Ensembl基因组数据库REST API。用于基因查询、序列检索、变异分析、比较基因组学、直系同源基因、VEP预测等基因组研究。

查询openFDA API以获取药物、器械、不良事件、召回、监管提交文件（510k、PMA）、物质识别（UNII）等数据，用于FDA监管数据分析和安全性研究。

此技能处理包含 figlet 标签的文件，并将其替换为 ASCII 艺术表示形式。它检测并保留注释样式（双正斜杠、井号、双连字符、正斜杠星号），自动管理 Node.js 依赖项，并支持 400 多种字体（默认使用标准字体）。当用户请求使用 figlet 标签语法将文件中的标记文本转换为 ASCII 艺术，或希望列出可用字体时，应使用此技能。

用于快速生物信息学查询的CLI/Python工具包。适用于快速BLAST搜索。可访问20多个数据库：基因信息（Ensembl/UniProt）、AlphaFold、ARCHS4、Enrichr、OpenTargets、COSMIC、基因组下载。如需高级BLAST/批量处理，请使用biopython。如需多数据库集成，请使用bioservices。

查询NHGRI-EBI GWAS Catalog以获取SNP与性状的关联。通过rs ID、疾病/性状、基因搜索变异，检索p值和汇总统计数据，用于遗传流行病学和多基因风险评分。

电子实验室笔记本 API 集成。访问笔记本、管理条目/附件、备份笔记本，与 Protocols.io/Jupyter/REDCap 集成，用于程序化 ELN 工作流。

这个技能应用于LaminDB——一款为生物学领域开发的开源数据框架，可让数据可查询、可追溯、可重现且符合FAIR原则。当您需要管理生物数据集（scRNA-seq、空间、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物本体论整理和验证数据、构建数据湖仓，或确保生物研究中的数据 lineage 和可重现性时，请使用此技能。涵盖数据管理、注释、本体论（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理器（Nextflow、Snakemake）和MLOps平台（W&B、MLflow）的集成，以及部署策略。

Linode API 文档

创建并验证7个项目文档（需求、架构、技术栈、API规范、数据库 schema、设计指南、运行手册）。ln-110-文档-流水线的第四个工作节点。

根据范围创建/重新规划 Epics（3-7 个 Epics）。批量预览 + 自动提取。先分解模式。自动发现团队 ID。

通过REST API访问NIH代谢组学工作台（4200多项研究）。查询代谢物、RefMet命名法、MS/NMR数据、m/z搜索、研究元数据，用于代谢组学和生物标志物发现。

用于机器学习的分子特征化（100+ 种特征化器）。ECFP、MACCS、描述符、预训练模型（ChemBERTa），将SMILES转换为特征，用于QSAR和分子机器学习。

N8N 文档 - 具备 AI 功能的工作流自动化平台

Ollama API 文档

访问RCSB PDB获取3D蛋白质/核酸结构。通过文本/序列/结构进行搜索，下载坐标（PDB/mmCIF），检索元数据，用于结构生物学和药物发现。