Intégration avec l'API de protocols.io pour la gestion des protocoles scientifiques. Cette compétence doit être utilisée lors du travail avec protocols.io pour rechercher, créer, mettre à jour ou publier des protocoles ; gérer les étapes et les matériaux des protocoles ; traiter les discussions et les commentaires ; organiser les espaces de travail ; téléverser et gérer les fichiers ; ou intégrer les fonctionnalités de protocols.io dans les flux de travail. Applicable pour la découverte de protocoles, le développement collaboratif de protocoles, le suivi des expériences, la gestion des protocoles de laboratoire et la documentation scientifique.
CE QUE VOUS DEVENEZ
Parfait pour ces scénarios
Identifier les interactions entre les facteurs de transcription qui stimulent la croissance tumorale à partir de données RNA-seq en vrac.
Cartographier les réseaux de régulation dans des données de séquençage d'ARN monocellulaire pour découvrir les facteurs de transcription spécifiques au type cellulaire.
Exécutez l'inférence GRN distribuée sur des jeux de données de transcriptomique massive avec des algorithmes scalables.
Prioriser les cibles médicamenteuses en validant les interactions TF-gène dans des réseaux spécifiques à la maladie.
GAIN MESURÉ
Avantages prouvés et impact mesurable
Accélérez la reconstruction des réseaux en quelques heures au lieu de plusieurs jours grâce à des algorithmes parallélisés.
Réduisez les dépenses en tirant parti d'un traitement distribué et efficace pour les grands ensembles de données.
Améliorez la fiabilité de la prédiction TF-cible avec les méthodes validées GRNBoost2/GENIE3.
CE QUE VOUS OBTENEZ
Fichiers, tags et installation en trois étapes
Conseil : Lisez la documentation et le code avant la première utilisation pour connaître son rôle et les permissions requises.
SCRIPTS SUIVANTS
Recommandé selon les tags et la catégorie
Système de génération d'agents de code Claude qui crée des agents et sous-agents personnalisés avec un en-tête YAML amélioré, des modèles d'accès aux outils et un support d'intégration MCP conformément à des modèles de production éprouvés
Générez et maintenez les fichiers AGENTS.md conformément à la convention publique agents.md. Utilisez-le lors de la création de documentation pour les flux de travail des agents IA, les guides d’intégration ou lors de la standardisation des modèles d’interaction des agents à travers les projets.
Validez que les schémas OpenAPI, Swagger et GraphQL correspondent à l'implémentation backend. Détectez les modifications brisantes, générez des clients TypeScript et assurez que la documentation API reste synchronisée. Utilisez-le lors de la manipulation de fichiers de spécification API (.yaml, .json, .graphql), de l'examen des modifications API, de la génération de types frontend ou de la validation des implémentations d'endpoints.
Plateforme de laboratoire en nuage pour les tests et la validation automatisés des protéines. Utilisez-la lors de la conception de protéines et lorsque vous avez besoin de validation expérimentale incluant des tests de liaison, des tests d'expression, des mesures de thermostabilité, des tests d'activité enzymatique ou l'optimisation des séquences protéiques. Utilisez-la également pour soumettre des expériences via API, suivre l'état des expériences, télécharger les résultats, optimiser les séquences protéiques pour une meilleure expression à l'aide d'outils informatiques (NetSolP, SoluProt, SolubleMPNN, ESM) ou gérer les flux de travail de conception de protéines avec validation en laboratoire humide.