📊 数据与AI

这个技能应在使用Python处理带注释的数据矩阵时使用，尤其是在单细胞基因组学分析、使用元数据管理实验测量或处理大规模生物数据集时。当任务涉及AnnData对象、h5ad文件、单细胞RNA-seq数据或与scanpy/scverse工具集成时使用。

围绕RDKit的Python化包装器，具有简化的界面和合理的默认值。适用于标准药物发现：SMILES解析、标准化、描述符、指纹、聚类、3D构象、并行处理。返回原生rdkit.Chem.Mol对象。如需高级控制或自定义参数，请直接使用rdkit。

用于质谱数据分析的OpenMS的Python接口。用于LC-MS/MS蛋白质组学和代谢组学工作流，包括文件处理（mzML、mzXML、mzTab、FASTA、pepXML、protXML、mzIdentML）、信号处理、特征检测、肽段鉴定和定量分析。在处理质谱数据、分析蛋白质组学实验或处理代谢组学数据集时应用。

图神经网络（PyG）。节点/图分类、链路预测、GCN、GAT、GraphSAGE、异构图、分子性质预测，用于几何深度学习。