Whole-slide image(WSI)およびマルチパラメトリックイメージングデータを分析するための計算病理ツールキット。組織病理スライド、H&E染色画像、多重免疫蛍光(CODEX、Vectra)、空間プロテオミクス、核の検出/セグメンテーション、組織グラフの構築、または病理データを用いたMLモデルのトレーニングを行う際にこのスキルを使用します。デジタル病理ワークフローのためにAperio SVS、NDPI、DICOM、OME-TIFFを含む160以上のスライド形式をサポートします。
あなたが手に入れるもの
これらのシナリオに最適
アルファ/ベータ多様性指標を計算し、微生物群集構造を可視化する
Newick形式のデータを使用して、進化的関係を構築・分析する
生物データセット内のパターンを探索するために、PCoAとPERMANOVAを実行する
比較ゲノミクスのため、FASTA 配列をインポート、分析、操作する
測定された効果
実証済みのメリットと測定可能な影響
最適化されたscikit-bioアルゴリズムでα/β多様性解析を効率化
統合ツールでツリーの構築と可視化を高速化
統一されたI/O関数で、複雑なマイクロバイオームデータ処理を簡素化
装備内容
ファイル・タグ・3ステップのインストール
ヒント: 初回使用の前にドキュメントとコードを読み、機能と必要な権限を確認してください。
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